Theodor Heinrich Boveri sinh ngày 12 tháng 10 năm 1862, trong một gia đình trung lưu ở Bamberg, Bavaria thuộc Đức. Tên ông thường được gọi tắt – theo người Đức – là Theodor trùng với cha của ông là một bác sĩ có họ tên đầy đủ là Johann Eugen Theodor; còn mẹ ông là Antonie Boveri.

• Do gia đình có nhiều con nhỏ, công việc kiếm được từ nghề bác sĩ lại thất thường, nên ông bà Boveri phải bán dần tài sản thừa kế. Bởi thế, trong thời niên thiếu của 4 anh em nhà Boveri, chỉ có con trai cả Albert được chăm sóc, học hành đầy đủ hơn cả, còn Theodor, Walter và con trai út Robert vất vả hơn.

Mãi sau này, người con thứ ba là Walter (1865-1914) chuyển đến Thụy Sĩ, trở thành kĩ sư máy móc, thành công trong kinh doanh ở đây, và là một doanh nhân có tiếng, là đồng sáng lập công ty Brown-Boveri & Cie (viết tắt là BBC) vào năm 1891. BBC nổi tiếng thế giới về thiết bị công nghiệp, tồn tại và phát triển gần 100 năm cho đến năm 1988 mới sáp nhập với công ty ASEA của Thụy Điển, tạo nên tập đoàn đa quốc gia Asea Brown Boveri gọi tắt là Tập đoàn ABB. Người con út là Robert (1873-1934) sau cũng chuyển về làm giám đốc của một công t y BBC vệ tinh của người anh.[2]

• Thời niên thiếu, Theodor có xu hướng thích văn học nghệ thuật, nên tốt nghiệp trung học xong đã ghi tên học về khoa học xã hội. Tuy nhiên đến năm 1881 (lúc 19 tuổi), thì Theodor lại chuyển sang học Sinh học và Giải phẫu học ở Đại học Munich. Ở đây, năm 1885 ông nhận bằng tiến sĩ về Tế bào học (cytology) sau khi bảo vệ thành công luận án "Nghiên cứu về dây thần kinh" (Beiträge zur Kenntnis der Nervenfasern), được giám sát bởi nhà giải phẫu học nổi tiếng thời đó là Carl von Kupffer.[3] Bằng cấp cao này đã cho phép anh ta được nhận học bổng để thực hiện nghiên cứu của mình trong phòng thí nghiệm danh tiếng của Richard Hertwig, thuộc khoa động vật học của trường đại học Munich.
• Năm 1893, Theodor được bổ nhiệm làm Giáo sư Động vật học và Giải phẫu học so sánh tại Đại học Würzburg và làm việc ở đó đến cuối đời. Ông mất ngày 15 tháng 10 năm 1915, thọ 53 tuổi.[4]
• Theodor đã kết hôn với bà Marcella O'Grady là nhà sinh vật học người Mỹ. Bà sinh ngày 7 tháng 10 năm 1863, cùng sống ở Đức với gia đình vqf mất ngày 24 tháng 10 năm 1950.[5] Con gái của họ là Margret Antonie Boveri (1900 - 1975) nổi tiếng là một trong những nhà báo kiêm nhà văn nổi bật nhất của Đức giai đoạn sau Chiến tranh thế giới thứ hai.[6]